Bugonys ist ein Dorf in Rajongemeinde Alytus, im Bezirk Alytus, Litauen. Bugonys liegt auf 119 m Höhe. Die Einwohnerzahl beträgt 24 (2021). Die nächste größere Stadt ist Alytus, 18,5 km nördlich. Zu den Sehenswürdigkeiten in der Umgebung gehören Grūtas-Park (24 km), Church of the Assumption, Merkinė (13,8 km) und White Rose Bridge (18,5 km). Zu den Naturdenkmälern gehören Noriūnai forest spruce (5,8 km).
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