Markutiškiai ist ein Dorf in Rajongemeinde Jonava, im Bezirk Kaunas, Litauen. Markutiškiai liegt auf 74 m Höhe. Die Einwohnerzahl beträgt 46 (2021). Die nächste größere Stadt ist Jonava, 10,2 km südwestlich. Zu den Sehenswürdigkeiten in der Umgebung gehören Schloss Siesikai (18,3 km), IX fortas (40 km) und Eisenbahnbrücke Jonava (9,4 km). Zu den Naturdenkmälern gehören Vainiai poplar (7,2 km).