Pavyžupys ist ein Dorf in der Gemeinde Kalvarija, im Bezirk Marijampolė, Litauen. Pavyžupys liegt auf 150 m Höhe. Die Einwohnerzahl beträgt 5. Die nächste größere Stadt ist Marijampolė, 25 km nordöstlich. Zu den Sehenswürdigkeiten in der Umgebung gehören Puńsk synagogue (16,1 km), Church of the Assumption in Puńsk (16,2 km) und Our Lady of Częstochowa church in Becejły (13,8 km).
Auch geschrieben Pavyžupys.
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