Vanaginė ist ein Dorf in Rajongemeinde Vilkaviškis, im Bezirk Marijampolė, Litauen. Vanaginė liegt auf 60 m Höhe. Die Einwohnerzahl beträgt 33 (2021). Die nächste größere Stadt ist Marijampolė, 28 km östlich. Nahe der Grenze: Russland, 13 km. Zu den Sehenswürdigkeiten in der Umgebung gehören Vilkaviškis Cathedral (4,8 km), Kirche Eydtkuhnen (14,6 km) und Church of the Holy Cross, Vilkaviškis (5,5 km).
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