Pagojys ist ein Dorf in Rajongemeinde Molėtai, im Bezirk Utena, Litauen. Pagojys liegt auf 147 m Höhe. Die nächste größere Stadt ist Utena, 27 km nordöstlich. Zu den Sehenswürdigkeiten in der Umgebung gehören Astronomisches Observatorium Molėtai (14,1 km), Synagoge (5,7 km) und Litauisches Museum für Ethnokosmologie (13,6 km).