Rapėjai ist ein Dorf in Rajongemeinde Molėtai, im Bezirk Utena, Litauen. Rapėjai liegt auf 162 m Höhe. Die nächste größere Stadt ist Utena, 42 km nördlich. Zu den Sehenswürdigkeiten in der Umgebung gehören Astronomisches Observatorium Molėtai (23 km), Dubingiai Castle (18,6 km) und Church of St. James the Apostle, Joniškis (7,0 km).
Auch geschrieben Rapėjai.