Markūnai ist ein Dorf in Rajongemeinde Trakai, im Bezirk Vilnius, Litauen. Markūnai liegt auf 157 m Höhe. Die nächste größere Stadt ist Vilnius, 37 km östlich. Zu den Sehenswürdigkeiten in der Umgebung gehören Wasserburg Trakai (18,0 km), Kathedrale von Vilnius (37 km) und Basilika Mariä Heimsuchung (17,1 km).
Auch geschrieben Markūnai.