Agerup ist eine Siedlung in der Gemeinde Samsø, in der Region Midtjylland, Dänemark. Die nächste größere Stadt ist Aarhus, 40 km nordwestlich. Zu den Sehenswürdigkeiten in der Umgebung gehören Ilsemade kilde (6,8 km), Nils Halses Høj (1,6 km) und Stenstuen (1,8 km). Zu den Naturdenkmälern gehören Dyret (4,4 km) und Lindholm (8,1 km).