Havndrup ist ein Dorf in der Gemeinde Faaborg-Midtfyn, in der Region Syddanmark, Dänemark. Havndrup liegt auf 53 m Höhe. Die nächste größere Stadt ist Odense, 16,2 km nordwestlich. Zu den Sehenswürdigkeiten in der Umgebung gehören Schloss Egeskov (13,8 km), Nonnebakken (15,8 km) und Wikingerzeitliche Ringburgen (15,8 km). Zu den Naturdenkmälern gehören Tornø (19,2 km) und Frederiksø (26 km).
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