Bækstrup ist ein Dorf in der Gemeinde Nyborg, in der Region Syddanmark, Dänemark. Bækstrup liegt auf 35 m Höhe. Die nächste größere Stadt ist Odense, 17,2 km westlich. Zu den Sehenswürdigkeiten in der Umgebung gehören Nonnebakken (16,9 km), Schloss Egeskov (17,2 km) und Wikingerzeitliche Ringburgen (16,9 km). Zu den Naturdenkmälern gehören Tornø (18,3 km) und Frederiksø (28 km).